home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410p.zip / M94A3281.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-25  |  3KB  |  43 lines
  1.        Document 3281
  2.  DOCN  M94A3281
  3.  TI    Mutations of basic amino acids of NCp7 of HIV-1 affect RNA binding in
  4.        vitro.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Schmalzbauer E; Dannull J; Guehmann S; Moelling K; Max-Planck-Institute
  7.        for Molecular Genetics, Berlin, FRG.
  8.  SO    Int Conf AIDS. 1994 Aug 7-12;10(1):111 (abstract no. PA0061). Unique
  9.        Identifier : AIDSLINE ICA10/94369294
  10.  AB    OBJECTIVES: The nucleocapsid (NC) protein of human immundeficiency virus
  11.        type 1 (HIV-1) is necessary during virion assambly for core formation
  12.        and packaging of the viral genomic RNA dimer. The NC protein of HIV-1
  13.        contains two clusters of basic aminoacids consisting of five and four
  14.        aminoacid residues respectively, flanking the first of its two zinc
  15.        fingers. The importance of these particular aminoacids for the binding
  16.        of RNA was to be examined. METHODS: Towards this aim these aminoacid
  17.        residues have been mutagenized to neutral ones individually as well as
  18.        in various combinations by site-directed mutagenesis. Wild type NCp7 and
  19.        the mutant proteins were expressed as recombinant proteins in E. coli
  20.        with six histidines as tags at their aminotermini in order to allow
  21.        efficient purification. The purified proteins were analyzed for RNA
  22.        binding in vitro using HIV-1 5' leader RNA transcribed in vitro. Assays
  23.        comprised North-Western blots at various salt concentrations and filter
  24.        binding tests which allow determination of the dissociation constants of
  25.        the various mutants. RESULTS AND CONCLUSIONS: The results indicate for
  26.        the first time that mutation of the three distinct aminoacids R7, R32,
  27.        and K33 are more critical for RNA binding than others. Mutation of the
  28.        other aminoacid residues reduce the binding affinity proportionately to
  29.        the number of mutations. Mutation of 7 out of the total of 9 basic
  30.        aminoacid residues reduces the binding by 50 to 90-fold. Thus, in
  31.        planning the construction of possible antiviral therapeutics the unique
  32.        role of these three particular aminoacids should be considered.
  33.  DE    Amino Acid Sequence  Amino Acids/CHEMISTRY
  34.        Capsid/CHEMISTRY/*GENETICS/*METABOLISM  Escherichia coli/GENETICS  Gene
  35.        Products, gag/CHEMISTRY/*GENETICS/*METABOLISM  Human  Hydrogen-Ion
  36.        Concentration  HIV-1/*GENETICS/*METABOLISM  In Vitro  Mutagenesis,
  37.        Site-Directed  Recombinant Proteins/CHEMISTRY/GENETICS/METABOLISM  RNA,
  38.        Viral/*METABOLISM  Zinc Fingers/GENETICS  MEETING ABSTRACT
  39.  
  40.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  41.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  42.  
  43.